O Auditor está dividido em diversos sistemas e cada um destes é dividido em diversos módulos.
Dependendo do ramo de atividade e da necessidade de cada empresa, o Sistema Auditor é configurado para disponibilizar alguns de seus sistemas e respectivos módulos.
Ainda, em cada módulo, poderá ser disponibilizado recursos de cadastramento, relatórios e rotinas programadas, a critério da empresa usuária.
Embora o Auditor uniformize o modo de utilização dos sistemas e módulos, é importante que o usuário tome conhecimento antecipado das particularidades de cada tela, relatório ou rotina que tiver que utilizar.

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